Да на Вреф действительно нужно подавать максимум  3 вольта. Но можно и от 5 просто не превышать 3 вольта резистором... Можно поставить и стабилитрон на 3 вольта подключенный через резистор на 1к к +5в и брать от туда 3 вольта... А можно не играться и впаять стабилитрон прямо к 15 лапе)))

Судя по схеме с 3 ногой можно ничего не делать. Но вход control определяет, куда выводится ШИМ: на выводы управления фазами - выходы A,B/C,D (control="1"), или на выводы управления Z-состоянием усилителя INH1/INH2 (control="0"). В первом случае при выключенном состоянии ШИМ-а обмотка ШД закорочивается ключами и ток в обмотке спадает медленно, во втором случае при выключенном состоянии ШИМ-а выходные ключи в Z-состоянии и обмотка ШД через диоды (те которые подключены на выходе L298) отдает свою энергию назад в источник и ток в ней быстро спадает. Медленный спад хорош тем, что меньше греется движок и ток стабилизируется более точно, но при этом двигателю тяжело быстро "шагать". При быстром спаде всё наоборот - движок греется сильнее, ток стабилизируется хуже, но скорость "шагания" - максимальная. Ещё при быстром спаде средний ток через обмотки на низких скоростях будет меньше, чем при медленном, т.е. будет некоторая потеря вращающего момента. Что выбрать - пожалуй однозначно сказать нельзя. В идеале - в разные моменты работы движка (останов, движение) надо выбирать разные режимы. Подключите его через джампер и выберите нужный режим))